Des biomarqueurs ADN/ARN pour le développement de diagnostics vétérinaires innovants
Découverte et validation de nouveaux biomarqueurs ADN / ARN
Les technologies de séquençage de nouvelle génération (NGS) et la qRT-PCR associées à des programmes de bioinformatique spécifiques visent à découvrir et à valider de nouveaux biomarqueurs ADN / ARN / génomique / transcriptomique. L’objectif : développer de nouveaux diagnostics innovants dans les applications vétérinaires.
Une méthode sensible et exhaustive
Les profils d’expression génique (transcriptomes) à travers des technologies de séquençage (New Generation Sequencing, NGS) et des outils bioinformatiques spécifiques visent à l’acquisition de nouvelles données ADN / ARN / génomique / transcriptomique. Ce processus quantitatif permet d’identifier tous les biomarqueurs impliqués dans chaque situation physiopathologique de manière exhaustive et sensible.
Une méthode sensible et exhaustive
Les profils d’expression génique (transcriptomes) à travers des technologies de séquençage (New Generation Sequencing, NGS) et des outils bioinformatiques spécifiques visent à l’acquisition de nouvelles données ADN / ARN / génomique / transcriptomique. Ce processus quantitatif permet d’identifier tous les biomarqueurs impliqués dans chaque situation physiopathologique de manière exhaustive et sensible.
La bioinformatique au service de la spécificité
Des programmes de bioinformatique spécifiques et une base de données sont pleinement nécessaires pour analyser les résultats générés par ces systèmes de séquençage de nouvelle génération (NGS), y compris l’analyse de séquence, l’annotation des gènes, la biologie évolutive computationnelle, la mesure de la biodiversité, l’analyse de la régulation, l’analyse de l’expression des protéines, l’analyse de mutation, etc.
Après ces traitements bioinformatiques, tous les résultats peuvent être mis en œuvre dans une base de données interactive et peuvent être comparés à d’autres profils d’expression génique (transcriptomes) établis par séquençage. Ainsi, chaque utilisateur peut facilement rechercher et comparer des profils d’expression génique (transcriptomes), et peut sélectionner des ensembles de biomarqueurs spécifiques dédiés à un tissu ou à une pathologie …
La bioinformatique au service de la spécificité
Des programmes de bioinformatique spécifiques et une base de données sont pleinement nécessaires pour analyser les résultats générés par ces systèmes de séquençage de nouvelle génération (NGS), y compris l’analyse de séquence, l’annotation des gènes, la biologie évolutive computationnelle, la mesure de la biodiversité, l’analyse de la régulation, l’analyse de l’expression des protéines, l’analyse de mutation, etc.
Après ces traitements bioinformatiques, tous les résultats peuvent être mis en œuvre dans une base de données interactive et peuvent être comparés à d’autres profils d’expression génique (transcriptomes) établis par séquençage. Ainsi, chaque utilisateur peut facilement rechercher et comparer des profils d’expression génique (transcriptomes), et peut sélectionner des ensembles de biomarqueurs spécifiques dédiés à un tissu ou à une pathologie …
Une validation des résultats au travers de la RT-qPCR
La PCR quantitative en temps réel peut être utilisée pour valider des biomarqueurs ADN/ARN identifiés dans une étape précédente, pour étudier des modèles globaux d’expression génique ou pour analyser en routine des biomarqueurs préalablement validés. Cette technique fournit une analyse quantitative absolue de l’expression des gènes et une confirmation rapide et précise des changements génétiques.
La PCR quantitative en temps réel (Real-Time quantitative PCR ou RT-qPCR) :
- Est la technique la plus sensible pour la détection et la quantification de l’ARNm
- Peut être utilisée pour quantifier les niveaux d’ARNm d’échantillons beaucoup plus petits
- Donne des mesures plus précises et est beaucoup mieux adaptée aux analyses effectuées sur un grand nombre d’échantillons
- A été développée avec succès et est devenue une méthode standard fiable et facile à utiliser pour la détection et / ou la quantification de séquences d’acides nucléiques
- Réduit le temps de manipulation et augmente la fiabilité
Une validation des résultats au travers de la RT-qPCR
Pour valider ces biomarqueurs ou dans une routine à haut débit, la PCR quantitative en temps réel peut être utilisée pour surveiller les modèles globaux d’expression génique. Cette technique fournit une analyse quantitative absolue de l’expression des gènes et une confirmation rapide et précise des changements génétiques.
La PCR quantitative en temps réel :
- Est la technique la plus sensible pour la détection et la quantification de l’ARNm
- Peut être utilisée pour quantifier les niveaux d’ARNm d’échantillons beaucoup plus petits
- Donne des mesures plus précises et est beaucoup mieux adaptée aux analyses effectuées sur un grand nombre d’échantillons
- A été développée avec succès et est devenue une méthode standard fiable et facile à utiliser pour la détection et / ou la quantification de séquences d’acides nucléiques
- Réduit le temps de manipulation et augmente la fiabilité
